Protein Fold

Вам дано ланцюжок залишків, деякі гідрофобні (H), а деякі ні. Складіть його на сітку, щоб гідрофобні залишки згрупувалися в заховане ядро ​​— кожна несусідна пара H-H, яка торкається, знижує енергію структури. Досягніть найменшої енергії, щоб її вирішити.

• Складіть ланцюжок, зігнувши її на сітці
• Упакуйте гідрофобні (H) залишки разом у ядро
• Кожен прихований H-H контакт зменшує загальну енергію
• Вдарте по цільовому фолду з низьким рівнем енергії, щоб очистити рівень

• Легка, середня або важка складність для довших ланцюгів
• Щоденна головоломка або практика для нових послідовностей

• Робочий стіл: натисніть і перетягніть, щоб зігнути та змінити форму ланцюжка
• Телефон і планшет: перетягніть ланцюжок пальцем, щоб скласти його

• Прагніть до компактної краплі, а не до довгого пасма — контакти утворюються лише тоді, коли залишки сидять поруч
• Засуньте залишки H всередину, а інші дайте на поверхню
• Підрахуйте потенційні пари H-H перед тим, як вибрати напрямок згортання

Protein Fold — це біохімічна головоломка, побудована на тому, як білки згортаються навколо гідрофобного ядра, принцип, який надає білкам форму.

• Навички: згортання білків, біохімія, гідрофобні взаємодії, структура та функції
• Найкраще для: приблизно 9–12 класи (від 14 років)
• Для батьків і вчителів: справжня концепція біохімії, складена в просторову головоломку.

Згортання ланцюжка гідрофобних і полярних залишків так, щоб гідрофобні ховалися в ядро, з очком за кожен несуміжний контакт H-H — це ґраткова HP-модель згортання білків.

Безпосереднє оцінювання прихованих контактів — оригінальне спрощення.

Це радикальне спрощення, що зберігає суттєву фізику. Гідрофобний ефект — злипання неполярних груп, бо це максимізує ентропію навколишньої води, — головна сила, що надає білку форми, тож модель майже без нічого іншого все одно дає впізнавано білкоподібні згортки.

Protein Fold — це біохімічна головоломка, побудована навколо моделей згортання білка з гідрофобним ядром. Це оригінальна безкоштовна браузерна гра, створена власноруч для PlayPendium.

Переглянути всі ігри →